Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms