Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CNTN2Q02246 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CNTN2Q02246 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms