Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
OTUD4Q01804 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms