Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PIP4K2BP78356 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PIP4K2BP78356 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms