Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO4P61968 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
LMO4P61968 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LMO4P61968 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO4P61968 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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