Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVK11-1P61568 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms