Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
FXYD4P59646 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FXYD4P59646 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms