Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NLRP6P59044 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NLRP6P59044 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms