Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RHBDL3P58872 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms