Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NUP107P57740 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms