Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AFDNP55196 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AFDNP55196 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AFDNP55196 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AFDNP55196 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms