Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SLC25A1P53007 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms