Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FNTBP49356 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms