Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CSNK1DP48730 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CSNK1DP48730 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms