Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PTGDSP41222 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms