Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHI3L1P36222 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CHI3L1P36222 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms