Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NUP214P35658 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NUP214P35658 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NUP214P35658 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms