Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
ABCD1P33897 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD1P33897 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms