Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTX2P32243 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTX2P32243 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
OTX2P32243 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
OTX2P32243 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms