Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSFA2P28290 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSFA2P28290 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms