Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NFKBIAP25963 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NFKBIAP25963 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms