Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GCSHP23434 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GCSHP23434 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GCSHP23434 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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