Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
USF1P22415 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
USF1P22415 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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