Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TAF1P21675 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TAF1P21675 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TAF1P21675 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TAF1P21675 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms