Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
XBP1P17861 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
XBP1P17861 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
XBP1P17861 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms