Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CTPS1P17812 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms