Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CD46P15529 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD46P15529 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CD46P15529 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CD46P15529 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CD46P15529 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CD46P15529 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms