Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB3P14651 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms