Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM27P14373 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM27P14373 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms