Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF35P13682 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms