Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODC1P11926 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODC1P11926 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODC1P11926 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODC1P11926 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODC1P11926 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms