Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
C4BP0C0L5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
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