Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CD74P04233 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CD74P04233 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CD74P04233 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CD74P04233 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms