Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-AP01891 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms