Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYF2O95926 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYF2O95926 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYF2O95926 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYF2O95926 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYF2O95926 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SYF2O95926 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SYF2O95926 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms