Protein–RNA interactions for Protein: O95487

SEC24B, Protein transport protein Sec24B, humanhuman

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24BO95487 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEC24BO95487 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC24BO95487 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms