Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPAG9O60271 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPAG9O60271 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
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