Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KIF1CO43896 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KIF1CO43896 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms