Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ANKRD28O15084 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms