Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC61Q9Y6R9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms