Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MED16Q9Y2X0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms