Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms