Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms