Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN11AQ9UI33 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCN11AQ9UI33 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms