Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
DKK2Q9UBU2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms