Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CPNE7Q9UBL6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CPNE7Q9UBL6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms