Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP36Q9P275 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms