Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GDE1Q9NZC3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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