Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RDH8Q9NYR8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RDH8Q9NYR8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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