Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MS4A12Q9NXJ0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms